hirsh_ben_arie (idelsong) wrote,
hirsh_ben_arie
idelsong

Categories:
Все знают из школьной программы о нескольких уровнях структуры белков: первичной - последовательности аминокислот; вторичной - участков с повторяющимися углами, на которые повернуты молекулы аминокислот; третичной - уникальной структуры, в которую свернута аминокислотная цепочка в молекуле белка; ну, и четвертичной - общей структуры, в которую могут собраться несколько аминокислотных цепочек.

levels-of-protein-structure

Представление о жестко фиксированной структуре белков было впервые сформулировано  Эмилем Фишером в 1894 г. и превратилось в популярную догму. Структуру белков можно изучить с помощью рентгеновской кристаллографии, и база данных содержит >90,000 таких структур.

При этом до начала 2000 гг биохимики не замечали, что они ищут под фонарем: существиет целый класс белков без фиксированной структуры, которые невозможно кристаллизовать и которые тем самым не попадают в базу данных. Более того, в большинстве белков четко структурированные участки чередуются с бесструктурными участками разной длины. В этих случаях кристаллизовали не целый белок, а только его структурированный участок.



Вот как это выглядит с белком SUMO-1, у которого структурированная середина и бесструктурные участки по сторонам.

shaker

Вот другой хороший пример: калиевый канал Shaker. Большая его часть находится внутри мембраны и строго структурирована. Есть еще  кусочек на N-конце, называемый ball. Канал - voltage-gated, то есть открывается после деполяризации мембраны. Через него начинают проходить ионы калия. При деполяризации происходит перемещение зарядов внутри мембраны, и внутренняя сторона оказывается слегка заряжена отрицательно. "Мячик" заряжен положительно, и как только он окажется достаточно близко к отрицательному заряду, он заткнет собой канал. А как быстро он там окажется - зависит от длины веревки, на которой он свободно болтается. Такая конструкция называется "энтропийные часы". Время полузатыкания -несколько миллисекунд. Канал должен открываться после деполяризации и закрываться через несколько миллисекунд.
Tags: чуть-чуть биологии
Subscribe

  • (no subject)

    Карта израильской политики. Стрелки показывают, кто с кем не сядет какать. Острие стрелки направлено на того, с кем не сядут какать. По-моему, я…

  • (no subject)

    Есть такое поселение - Йитав. Когда-то это был кибуц, и название его - аббревиатура, честь Ицхака Табенкина. Но постепенно кибуц вымер, а в поселении…

  • (no subject)

    Йевамот 63а Жена Рава вечно изводила его. Попросит ее проготовить чечевицу - приготовит хумус. Попросит приготовить хумус - приготовит чечевицу.…

  • Post a new comment

    Error

    default userpic

    Your reply will be screened

    When you submit the form an invisible reCAPTCHA check will be performed.
    You must follow the Privacy Policy and Google Terms of use.
  • 33 comments

  • (no subject)

    Карта израильской политики. Стрелки показывают, кто с кем не сядет какать. Острие стрелки направлено на того, с кем не сядут какать. По-моему, я…

  • (no subject)

    Есть такое поселение - Йитав. Когда-то это был кибуц, и название его - аббревиатура, честь Ицхака Табенкина. Но постепенно кибуц вымер, а в поселении…

  • (no subject)

    Йевамот 63а Жена Рава вечно изводила его. Попросит ее проготовить чечевицу - приготовит хумус. Попросит приготовить хумус - приготовит чечевицу.…