hirsh_ben_arie (idelsong) wrote,
hirsh_ben_arie
idelsong

Categories:
Все знают из школьной программы о нескольких уровнях структуры белков: первичной - последовательности аминокислот; вторичной - участков с повторяющимися углами, на которые повернуты молекулы аминокислот; третичной - уникальной структуры, в которую свернута аминокислотная цепочка в молекуле белка; ну, и четвертичной - общей структуры, в которую могут собраться несколько аминокислотных цепочек.

levels-of-protein-structure

Представление о жестко фиксированной структуре белков было впервые сформулировано  Эмилем Фишером в 1894 г. и превратилось в популярную догму. Структуру белков можно изучить с помощью рентгеновской кристаллографии, и база данных содержит >90,000 таких структур.

При этом до начала 2000 гг биохимики не замечали, что они ищут под фонарем: существиет целый класс белков без фиксированной структуры, которые невозможно кристаллизовать и которые тем самым не попадают в базу данных. Более того, в большинстве белков четко структурированные участки чередуются с бесструктурными участками разной длины. В этих случаях кристаллизовали не целый белок, а только его структурированный участок.



Вот как это выглядит с белком SUMO-1, у которого структурированная середина и бесструктурные участки по сторонам.

shaker

Вот другой хороший пример: калиевый канал Shaker. Большая его часть находится внутри мембраны и строго структурирована. Есть еще  кусочек на N-конце, называемый ball. Канал - voltage-gated, то есть открывается после деполяризации мембраны. Через него начинают проходить ионы калия. При деполяризации происходит перемещение зарядов внутри мембраны, и внутренняя сторона оказывается слегка заряжена отрицательно. "Мячик" заряжен положительно, и как только он окажется достаточно близко к отрицательному заряду, он заткнет собой канал. А как быстро он там окажется - зависит от длины веревки, на которой он свободно болтается. Такая конструкция называется "энтропийные часы". Время полузатыкания -несколько миллисекунд. Канал должен открываться после деполяризации и закрываться через несколько миллисекунд.
Tags: чуть-чуть биологии
Subscribe

  • (no subject)

    Посмотрели вчера почти двухчасовую передачу, где 91-летняя Эра Коробова рассказывает о своей жизни и о разных людях. Там все смотреть приятно. Мне…

  • (no subject)

    Знаете такую фотографию? Это - большая (неологическая) синагога в Будапеште. На фотографии 1942 г. - евреи-бывшие офицеры, они пришли в форме, чтобы…

  • (no subject)

    Рассказ Л. Утесова о поездке с Бабелем на дачу к Ежову <автору книги о Бабеле С.Н.Поварцову> довелось услышать в октябре 1970 года. Леонид…

  • Post a new comment

    Error

    default userpic

    Your reply will be screened

    When you submit the form an invisible reCAPTCHA check will be performed.
    You must follow the Privacy Policy and Google Terms of use.
  • 33 comments

  • (no subject)

    Посмотрели вчера почти двухчасовую передачу, где 91-летняя Эра Коробова рассказывает о своей жизни и о разных людях. Там все смотреть приятно. Мне…

  • (no subject)

    Знаете такую фотографию? Это - большая (неологическая) синагога в Будапеште. На фотографии 1942 г. - евреи-бывшие офицеры, они пришли в форме, чтобы…

  • (no subject)

    Рассказ Л. Утесова о поездке с Бабелем на дачу к Ежову <автору книги о Бабеле С.Н.Поварцову> довелось услышать в октябре 1970 года. Леонид…